V moskovskom metre je niekoľko tematických vlakov. Najznámejšou a najfarebnejšou z nich je „Aquarelle“, ktorá vedie po línii Arbatsko-Pokrovskaya. Obyvateľom a hosťom hlavného mesta sa myšlienka takýchto vlakov veľmi páčila, takže tematických automobilov pribúda.
Najstarším z momentálne fungujúcich tematických tímov sú Ľudové milície. Vlak bol prvýkrát uvedený do prevádzky v roku 1989 na trati Zamoskvoretskaya. Vlak sa spočiatku nelíšil od zvyšku vozidiel metra, jeho dizajn bol však aktualizovaný 8. novembra 2006. Tento vlak nemá konkrétny cestovný poriadok a môže sa kedykoľvek objaviť. Výraznou črtou „Ľudových milícií“sú materiály o Veľkej vlasteneckej vojne, ktoré sú prezentované vo vnútri salónu.
Ďalšou tematickou kompozíciou je „Kursk Bulge“. Svoju prácu začala 8. mája 2003 na trati Sokolnicheskaya. Vlak bol vyzdobený na pamiatku 60. výročia bitky pri Kursku. „Kursk Bulge“pozostáva zo siedmich automobilov, hlavné sú zdobené stužkami svätého Juraja a kovovými platňami. Vo vnútri môžete vidieť informácie o histórii obrneného vlaku moskovského metra.
Na počesť 75. výročia vôbec prvého značkového vlaku Petrohrad - Moskva bol vydaný vlak Červená šípka - 75 rokov. Vlak je natretý červenou farbou, tiež je tu výrazný žltý vodorovný pruh, na dverách sa chváli štylizovaná číslica 75. V interiéri sú červené sedadlá a červenkastá trblietavá podlaha, žlté madlá. Steny zdobia plagáty príbehu Červenej šípky.
Veľmi neobvyklý je vlak Aquarelle uvedený na trh v roku 2007, ktorý predstavuje celú obrazovú galériu reprodukcií umelca Sergeja Andrijaku a najtalentovanejších študentov jeho školy. Osvetlenie bolo namontované nad obrazmi a niekoľko veľkých okien a sedadiel bolo odstránených. Vonku je vlak a vozne pokryté fóliou s kresbami ovocia a kvetov, každý vozeň je jedinečný.
Originálny dizajn má aj skladba „Čítanie Moskvy“, s ktorou sa začalo pracovať 31. mája 2008. Vonku má výzdobu v štýle akcie „Čítam Moskvu“, zatiaľ čo vo vlaku je zbierka obrazov literárnych postáv a ukážok z mnohých diel pre deti i dospelých.
Veľmi krásne vyzerá retro vlak „Sokolniki“, ktorý má vzhľad úplne prvého vlaku v Moskve. Vlak je vymaľovaný v štýle metra z 30. rokov 20. storočia, ale tento vlak nie je presnou replikou vtedajšieho vlaku.
1. augusta 2012 vyšiel nový tematický vlak, ktorý vznikol na počesť 175. výročia ruských železníc. Steny automobilov zdobia plagáty s históriou a fotografiami ruských železníc, vo vlaku nebude reklama.